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bwin必赢国际官网APP在转录组m6A甲基化修饰生物信息学研究方面取得新进展

近日,由bwin必赢国际官网APP刘辉(共同一作)、陈兴(共同通信)、王怀志(学生、共同一作)、华刚、张林及其他单位合作者共同撰写的论文《MeT-DB V2.0: elucidating context-specific functions of N6-methyl-adenosine methyltranscriptome》被Nucleic Acid ResearchNAR,核酸研究)杂志接收并在线发表。Nucleic Acid Research是生物生化、分子生物、生物信息学等领域的权威期刊,2016年影响因子10.162。这是刘辉副教授及合作者于2015年后,第二次在NAR杂志上发表论文。

刘辉等人于2015年发布的MeT-DB是首个全面收集转录组m6A甲基化修饰的相关实验信息的数据平台。MeT-DB V2.0则在MeT-DB的基础上进行了大量的数据更新和功能提升。MeT-DB V2.0是目前最为全面的针对m6A的高质量信息平台之一,对相关领域生物实验设计、实验结果的对照分析、生物学意义的解释,以及相关生物信息学方法的模型设计、性能评估具有重要的意义。


相关背景介绍:

m6A是一种动态可逆的转录组修饰方式,在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性等方面扮演重要角色,并与疾病等生命现象存潜在联系,有着重要的研究意义。由于m6A相关调控蛋白的发现和高通量检测手段的发明,m6A迅速成为遗传领域的研究热点,同时也为相关数据的处理带来了很大的挑战。近年来,刘辉等人与美国德州大学、西交利物浦大学、南加州大学、西北工业大学的学者深入合作,针对m6A相关高通数据设计开发了一系列数据处理算法和信息平台,在相关研究领域有一定的影响力。

生物信息学(Bioinformatics)是利用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法,研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科。生物信息学(Bioinformatics)揭示生物大数据所包含的生物学奥秘,是当今自然科学的重大前沿交叉领域之一。

20166月我校首批越崎学者陈兴教授创建成立了bwin必赢国际官网APP生物信息研究所,刘辉和张林均为研究所骨干成员。一年多以来研究所成员各方面取得了丰硕成果,共计发表SCI论文60余篇。其中,论文通讯作者研究所陈兴所长进入矿大一年多发表SCI论文50篇左右,影响因子合计超过200

刘辉2007年起涉及生物信息学相关课题的研究。受国家留学基金委资助,于2007.9-2009.3赴德州大学圣安东尼奥分校访学,于2015.9-2016.12再次赴南加州大学访问并成为所在实验室全职助理研究员。主持和参与多项国家、省部级以及校内的科研项目。发表学术论文30余篇,其中一作单篇最高影响因子10.162,单篇最高引用71次。出版专著2部。获多项省部级奖励。


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